miRNA熒光定量檢測服務(wù),通常指基于實時熒光定量PCR技術(shù)的成熟檢測方案,為客戶提供從樣本到數(shù)據(jù)分析的完整miRNA表達定量服務(wù)。其核心原理在于將微小的miRNA分子通過一系列精密步驟,轉(zhuǎn)化為可被熒光信號實時監(jiān)測并準確定量的PCR產(chǎn)物。
第一步:高質(zhì)量RNA的提取與富集是成功的基石。由于miRNA片段小且易降解,提取必須能高效回收小RNA,并去除蛋白質(zhì)、基因組DNA等雜質(zhì)。服務(wù)通常采用專門的試劑盒,利用玻璃纖維濾膜或磁性珠特異性地結(jié)合小RNA,或通過有機萃取與選擇性沉淀進行分離。對于血漿、血清等體液樣本,還需額外步驟去除高豐度的核糖體RNA并克服PCR抑制劑的影響。提取的RNA會經(jīng)過精密儀器進行質(zhì)量檢測與定量,確保其純度和完整性滿足下游實驗要求。
第二步:特異性逆轉(zhuǎn)錄是將miRNA轉(zhuǎn)化為穩(wěn)定cDNA的關(guān)鍵。由于miRNA長度極短,傳統(tǒng)的隨機引物或Oligo dT法無法適用。服務(wù)采用兩種主流策略。一是添加poly聚合酶在miRNA的3'末端加上一段通用序列,再使用與該序列互補的通用引物進行逆轉(zhuǎn)錄。二是使用莖環(huán)結(jié)構(gòu)的特異性逆轉(zhuǎn)錄引物,其一段序列與特定miRNA的3'端互補,另一段形成延伸的通用序列。后者特異性較高,是區(qū)分高度同源miRNA家族成員的金標準方法。此步驟將不同的miRNA轉(zhuǎn)化為帶有共同引物結(jié)合位點的cDNA,為后續(xù)的通用PCR擴增奠定基礎(chǔ)。

第三步:實時熒光定量PCR擴增與檢測是實現(xiàn)精確定量的核心。以上一步獲得的cDNA為模板,在含有特異性上游引物、下游通用引物、DNA聚合酶和熒光報告系統(tǒng)的反應(yīng)體系中進行PCR循環(huán)。特異性上游引物針對目標miRNA的獨特序列設(shè)計。熒光檢測主要采用TaqMan探針法或SYBR Green染料法。TaqMan法使用一個與目標序列互補、兩端分別標記熒光報告基團和淬滅基團的探針,當PCR延伸時探針被切割,報告熒光釋放,其信號強度與擴增產(chǎn)物量成正比,特異性較強。SYBR Green法則是一種可嵌入雙鏈DNA的染料,其熒光強度與所有雙鏈DNA產(chǎn)物總量相關(guān),經(jīng)濟但需通過熔解曲線分析確認產(chǎn)物特異性。儀器實時監(jiān)測每個循環(huán)結(jié)束時的熒光強度,通過設(shè)定閾值,記錄每個反應(yīng)管內(nèi)熒光信號達到閾值所需的循環(huán)數(shù)。
第四步:數(shù)據(jù)歸一化與定量分析是獲得生物學結(jié)論的較后一步。由于樣本間RNA提取效率、逆轉(zhuǎn)錄效率存在差異,必須對數(shù)據(jù)進行歸一化校正。服務(wù)會檢測每個樣本中內(nèi)參基因的表達量,常用如U6 snRNA、miR-16等穩(wěn)定表達的小RNA。隨后,通過比較法,計算目標miRNA相對于內(nèi)參基因的表達差異,較終以相對定量的形式呈現(xiàn)結(jié)果,例如“實驗組中目標miRNA的表達量是對照組的X倍”。
綜上所述,一項專業(yè)的miRNA熒光定量檢測服務(wù),是分子生物學、流體力學、化學與信息學的精密融合。它通過標準化的操作流程、經(jīng)過驗證的引物探針、嚴格的質(zhì)控體系以及專業(yè)的生物信息學分析,將痕量的miRNA轉(zhuǎn)化為可靠、可重復的表達數(shù)據(jù),為基礎(chǔ)研究、生物標志物發(fā)現(xiàn)與臨床診斷提供堅實的數(shù)據(jù)支撐。